焦虑症不完全等同于传统意义上的“神经系统疾病”，它在医学上更常被归类为精神心理疾病（或精神障碍），但与神经系统功能异常密切相关。
具体关联和区别如下：
与神经系统的密切性：焦虑症的发生与大脑神经系统功能紊乱直接相关，例如大脑内5-羟色胺、去甲肾上腺素等神经递质失衡，杏仁核（处理恐惧情绪的脑区）过度活跃、前额叶皮层（调控情绪的脑区）功能减弱等，这些都是神经系统层面的变化，也是药物和物理治疗焦虑症的核心靶点。
与传统神经系统疾病的区别：传统神经系统疾病（如脑梗塞、帕金森病、癫痫）以神经系统器质性损伤（如脑组织坏死、神经元变性、异常放电）为核心，症状多表现为运动、感觉、意识等直接障碍；而焦虑症的核心是过度焦虑、恐惧等心理症状，虽伴随神经功能变化，但通常不具备典型的、不可逆的神经系统器质性损伤（长期严重焦虑可能间接影响脑区结构，如海马体体积变化，但非核心特征）。